മുഖ്യമന്ത്രി പിണറായി വിജയന്റെ  ചീഫ് പ്രിൻസിപ്പൽ സെക്രട്ടറി കെ.എം. എബ്രഹാം വരുമാനത്തിൽ നിന്ന് വ്യത്യസ്തമായി സ്വത്ത് സമ്പാദിച്ചുവെന്ന ആരോപണത്തിൽ സിബിഐ അന്വേഷണം നടത്താൻ കേരള ഹൈക്കോടതി ഉത്തരവിട്ടു. ആക്ടിവിസ്റ്റ് ജോമോൻ പുത്തൻപുരക്കൽ സമർപ്പിച്ച ഹർജിയെ തുടർന്നാണ് ജസ്റ്റിസ് കെ. ബാബു ഈ ഉത്തരവ് പുറപ്പെടുവിച്ചത്. നേരത്തെ സംസ്ഥാന വിജിലൻസ് ആൻഡ് ആന്റി കറപ്ഷൻ ബ്യൂറോയെ (വിഎസിബി) സമീപിച്ചിരുന്ന ജോമോൻ പുത്തൻപുരയ്ക്കൽ നൽകിയ ഹർജിയിലാണ് ജസ്റ്റിസ് കെ. ബാബു ഈ ഉത്തരവ് പുറപ്പെടുവിച്ചത്. തെളിവുകളുടെ അഭാവം ചൂണ്ടിക്കാട്ടി വിഎസിബി കേസ് അവസാനിപ്പിച്ചു, പ്രത്യേക കോടതി പരാതി തള്ളിയതിനെ തുടർന്ന് ഹർജിക്കാരൻ ഹൈക്കോടതിയെ സമീപിച്ചു.

2000 നും 2015 നും ഇടയിൽ മുംബൈയിൽ 3 കോടി രൂപ വിലമതിക്കുന്ന ഒരു അപ്പാർട്ട്മെന്റ്, തിരുവനന്തപുരത്ത് 1 കോടി രൂപ വിലമതിക്കുന്ന മറ്റൊന്ന്, കൊല്ലത്ത് 8 കോടി രൂപ വിലമതിക്കുന്ന മൂന്ന് നില ഷോപ്പിംഗ് കോംപ്ലക്സ് എന്നിവയുൾപ്പെടെ എബ്രഹാം ഗണ്യമായ സ്വത്തുക്കൾ സമ്പാദിച്ചതായി ഹർജിയിൽ പറയുന്നു. പ്രാഥമിക അന്വേഷണ റിപ്പോർട്ടും അനുബന്ധ സാമഗ്രികളും പരിശോധിച്ച ശേഷം ഹൈക്കോടതി, എബ്രഹാം വരുമാനത്തിൽ നിന്ന് വ്യത്യസ്തമായി ജംഗമ, സ്ഥാവര സ്വത്തുക്കൾ കൈവശം വച്ചിട്ടുണ്ടെന്ന് പ്രഥമദൃഷ്ട്യാ തെളിവുകൾ കണ്ടെത്തി.  ഗണ്യമായ സ്വത്തുക്കൾ മനഃപൂർവ്വം ഒഴിവാക്കിയതായി തോന്നുന്ന ഒരു അന്വേഷണം നടത്തിയതിന് വിഎസിബിയെ കോടതി വിമർശിക്കുകയും അന്വേഷണത്തിന്റെ വിശ്വാസ്യതയെ ചോദ്യം ചെയ്യുകയും ചെയ്തു.

എബ്രഹാമിന്റെ സ്വാധീനമുള്ള സ്ഥാനവും മുഖ്യമന്ത്രിക്ക് റിപ്പോർട്ട് ചെയ്യുന്നതിനാൽ വിഎസിബിയുടെ സ്വാതന്ത്ര്യമില്ലായ്മയും കണക്കിലെടുത്ത് – സിബിഐ അന്വേഷണം മാത്രമേ നീതിയും പൊതുജനവിശ്വാസവും ഉറപ്പാക്കൂ എന്ന് കോടതി വിധിച്ചു. എഫ്‌ഐആർ രജിസ്റ്റർ ചെയ്യാനും കേസ് ഫയലുകൾ വിഎസിബിയിൽ നിന്ന് ഏറ്റെടുക്കാനും സിബിഐയുടെ കൊച്ചി യൂണിറ്റിനോട് നിർദ്ദേശിച്ചിട്ടുണ്ട്. വിരമിച്ച ഐഎഎസ് ഉദ്യോഗസ്ഥനും കേരള ഇൻഫ്രാസ്ട്രക്ചർ ഇൻവെസ്റ്റ്‌മെന്റ് ഫണ്ട് ബോർഡിന്റെ നിലവിലെ സിഇഒയുമായ എബ്രഹാം സംസ്ഥാന സർക്കാരിൽ കാബിനറ്റ് റാങ്ക് പദവി തുടരുന്നു.